A csapat együttműködik a lovasrendőrséggel, hogy elkapjon egy gyilkost, aki megölt egy tengerésztisztet a nemzeti parkban. Fel kell számolniuk egy illegális afrikai húscsemépsz hálózatot is.

Egy tengerészgyalogos meggyilkolása összeköthető egy régi cross motoros bandával, amelynek Torres is tagja volt fedettügynökként.

McGee és a csapat versenyez, hogy ki találja meg a hackert, aki felelős az altábornagy laptopjának megfertőzéséért.

A csapatnak egy bosszantó vietnami háborús veteránra kell támaszkodnia, hogy megtalálja Andrew Back tizedes gyilkosát.

Gibbst arra kéri régi barátjának rákos beteg lánya, Laura, hogy segítsen felderíteni egyik tengerésztársának halálát. A nyomozás során kiderül, hogy kábítószerbiznisz van az ügy hátterében, és Gibbs Torrest a kórházba küldi, hogy vigyázzon Laurára. Torres nem hajlandó vállalni a feladatot.

Jenna Flemming arra biztatja Vance igazgatót, hogy vállaljon pozíciót a kongresszusban. McGee lakásában betörők járnak, és egyiküket lelövi. A nyomozás során a szálak egy tizenöt éve megoldatlan gyémántlopási ügyhöz vezetnek.

Egy őrnagy halálának körülményeit vizsgálva ismét képbe kerül Chen Kai. Bishop és Reeves a tiltás ellenére követik a nyomot, de legnagyobb meglepetésükre Gibbs-szel találják szemben magukat.

Vance igazgató utasítja Abbyt, hogy tervezzen meg és hajtson végre egy vegyi támadást a belbiztonság megrendelésére. Az akciónak az a célja, hogy feltárja a sebezhető pontokat. Azonban úgy tűnik, hogy Abby nem csak a gonoszok elleni harcban nagyon jó.

A Kettering szakaszvezető gyilkosa utáni nyomozás újra Gibbs útjába sodorja a Sherlock-konzorciumot. Az amatőr nyomozócsoport új tagja nagy meglepetést okoz. A nyomozás során egy piti bűnöző sorozatos rablásaira is fény derül.

A tetthelyre kiérkezve, Jimmy észreveszi, hogy egy fiatal fiú készül leugrani a szomszédos épület párkányáról, és gondolkodás nélkül kimászik hozzá. Miközben a csapat megpróbálja kideríteni, ki ütötte el a srác apját, Jimmy igyekszik meggyőzni Ryant, hogy ne dobja el az életét, felhasználva Doki egyik mondását: "Ha a poklon mész át, menj tovább."

Chen Kai egy üzletember, aki a gyanú szerint terrorcselekményekkel manipulálja a tőzsdét. A Willoughby-akciónak az lenne a lényege, hogy bizonyítékot találjanak Chen ügyleteire. Reeves-nek sikerül feljutnia másodpilótaként az üzletember magángépére, de valaki súg Chennek.

Torres és Reeves továbbra is az erejüket próbálgatják. Egy halott ezredes zsebében McGee megtalálja Doki régi lakcímét, akiben elemi erővel törnek fel az édesanyjára vonatkozó emlékek.

Bishop bátyjai, George, Robert és John váratlanul meglátogatják Ellie-t, és leginkább az érdekli őket, kivel jár. Torres felhívja figyelmüket Clayton Reeves-re. Abby a meggyilkolt Reza ezredes laptopján arra vonatkozó adatokat talál, hogy egy Guantanamón őrzött fogoly ártatlanságát akarta bebizonyítani. Bishop javaslatára Gibbs Kaszimot jelöli ki, hogy együtt dolgozzanak az ügyön.

Jenna Fleming képviselőnőt egy tengerészeti bázison megfenyegetik, ezért Vance igazgató vállalja a védelmét. Clayton Reeves, az MI6 tisztje, az NCIS nemzetközi ügyeinek intézője és Torres egyfolytában csipkelődnek. Quinn pedig észreveszi, hogy Reeves asztalán a Willoughby-ügy aktája van.

Egy tengerész meggyilkolásának tanúja lesz egy mexikói bevándorló, Victor Medina, akit a hatóságok ki akarnak utasítani, de Gibbs és a csapata megpróbál rajta segíteni. Quinn ügynök Jethro-val álmodik, ami nem hagyja nyugodni. Tony az apjára bízza, hogy a volt lakását kiadja. Mivel McGee, Abby és Bishop is pályázik a lakásra, idősebb DiNozzo úr képtelen dönteni. A sorsolás azonban Torres-nek kedvez.

A tengerészet tizedese, Kelly Ristow eltűnik, majd kiderül, hogy elrabolták. A nyomozás során férjének holtteste is előkerül. A bűnjelek egy fiktív céghez vezetnek, de valaki tévútra akarja terelni a nyomozást. Gibbs értésére adja Torres-nek, hogy ő is része már a családnak.

Torres terepen szeretne dolgozni, mert az irodában még a nyomtatókkal is meggyűlik a baja. Bishop-ot és Quinn-t Philadelphiába küldi Gibbs, hogy nyomozzanak egy halott tengerész gyilkosai után. Quinn-ben szörnyű emlékeket idéz fel a város. Az ügy kapcsán közben a londoni MI5 egyik ügynöke is gyanúba keveredik.

A főhadnagy holttestére bukkannak egy romboló hajó fedélzetén, miután arra szabad bejárást kaptak civilek egy teljes éjszakára. Gibbs Palmer-rel és Quinn-nel együtt a tengerre utazik, hogy kinyomozzák, vajon, miért történhetett a gyilkosság.

Hill őrmester lezuhan az ötödik emeletről, de a pszichiátere figyelmezteti Gibbs-t, hogy ne tekintse ezt öngyilkosságnak. Torres ügynök lakást keres, és a halott házában is körülnéz. Fornell ügynök eközben lakótársként elég sok gondot okoz Gibbs számára.

Egy gimis-találkozón az évfolyam egyik volt diákja mérgezés következtében meghal. Gibbs azonnal munkára fogja a csapat új tagjait, Torres-t és Quinn-t is. Az áldozat lakásán rengeteg lopott cuccot találnak, és kiderül, hogy a volt osztálytársak együtt követték el a rablásokat. Viszont nincs meg a gyilkos.