A második évadban megtalálják Dexter lerakatát, ahol áldozatai testrészeit tárolta. A Bay Harbour-i Mészáros utáni nyomozást Lundy ügynök vezeti.

Miután megölte testvérét, a hűtőkocsis gyilkost, Dexter úgy érzi képtelen újra ölni. Természetesen akar, és valójában szüksége is van rá, de a rátörő érzések elbátortalanítják, amit nem igazán ért. Miután majdnem a hűtőkocsis áldozatává vált, Debra újra szolgálatba áll a Miami-i Rendőrségen, de lehet, hogy nem áll még készen a feladatra.

Dexter, továbbra is próbálja visszanyerni gyilkos ösztöneit, folytatja Little Chino, egy nagypályás gengszter utáni hajszáját. Debra meg van győződve róla, hogy már túltette magát a jegeskocsis gyilkos okozta traumán, de elveszti az irányítást munkája felett. Miközben mindketten a közelmúltjuk megpróbáltatásaival küzdenek, Lundy FBI ügynök érkezik a Miami-i Rendőrségre, hogy segítsen végre felderíteni egy újonnan felbukkant sorozatgyilkos ügyét.

Dexter szemet vetett új áldozatára: egy visszataszító gyilkosra, aki egy használtautó kereskedő. Dexter nem képes tovább hazudni Ritának éjszakai tevékenységéről, aki azt hiszi róla, hogy drogfüggő. Megfenyegeti, hogy elhagyja őt, ha nem vesz részt egy elvonókúrán, ahol összetalálkozik egy szexis, rejtélyes nővel, Lilával.

Rita édesanyja látogatóba érkezik, és rossz érzései támadnak Dexterrel kapcsolatban. Angel egyik tanúkihallgatásán átlépi a határvonalat.

Dexter megtudja, hogy a férfi, aki megölte édesanyját, még mindig életben van. Mikor elmondja Lila-nak, azt javasolja Dexternek, hogy nézzen szembe a férfival a függőségéből való talpraállás részeként...

Egy gyilkos hasonló tetteivel átveszi az öbölbeli mészáros szerepét. Dexternek meg kell semmisítenie egy terhelő bizonyítékot tartalmazó videófelvételt.

Dexter elintézi, hogy Doakes leszálljon róla. Kitalál egy tervet, amivel a rendőrséget egy másik irányba tereli. Lila és Dex kapcsolata erősödik, és van egy kis vitája Ritával és a srácokkal is.

Dexter-t megtámadja egy férfi, aki előzőleg végzett saját édesanyjával is. Mindeközben, Lila közelebb akar kerülni Dex-hez, míg Debra és Lundy az öbölbeli mészáros nyomában van.

Dexter rájön, hogy nem lesz könnyű teljesen lezárni a dolgokat Lila-val. Dexter megpróbál továbbra is a nyomozás élén maradni, amint a 'Mészáros' utáni embervadászat fokozódik. Dexter egyik ellensége felfedezi titkát.

Doakes követi Dexter-t a következő bűntény színhelyére és meglepi őt egy Harry-vel kapcsolatos kijelentéssel. A Mészárost üldöző nyomozó csoport, úgy gondolja megtalálta végre emberét...

Dexter-nek egy súlyos döntést kell meghoznia, mely hatással lehet az eddigi ügyeire. Mindeközben Lila egy titokkal tér vissza, hogy megzsarolja Dexter-t...

A nyomozási csoport úgy gondolja, hogy a Mészáros ügyét lezárhatják, de Dexter még mindig nem tud kiegyezni ezzel...