Panama fölött lezuhan egy repülőgép. Joe Hendersont, a gép egyik életben maradt utasát kémkedés gyanújával őrizetbe veszik a helyi hatóságok. MacGyver is tagja annak a maroknyi csapatnak, amelyet arra a feladatra kérnek fel, hogy a bajba jutott férfit kimenekítse.

MacGyver egy sikeres akcióból tér haza Közép-Amerikából. Ám a sok izgalommal járó feladat után úgy érzi, itt az ideje, hogy abbahagyja az állandó veszedelemmel járó életmódot. Az Alapítvány által számára szervezett születésnapi parti vendégei viszont felelevenítik legsikeresebb akcióit. Ez megingatja az ünnepeltet az amúgy sem túl erős elhatározásában.

MacGyver egy bajba jutott barátjától segélykérő hívást kap. Mivel annak idején Tony Braddock segítette sikeres szökésében egy marokkói börtönből, MacGyver nem halogatja a dolgot, és a férfi segítségére siet. Még éppen időben érkezik, hogy egy különösen veszélyes merénylet tervéről értesüljön. Viszont menekülés közben rálőnek, és mikor magához tér, elveszíti az emlékezetét.

MacGyvernek Csehszlovákiában kell börtönéből kihoznia egy neves ellenzéki személyiséget. A rutinfeladatot megnehezíti, hogy neki magának is álcát kell öltenie: egy nászutas pár férfitagjaként partnernőt is kell magával vinnie.

Az egyedülálló nemzeti értéket képviselő Ming sárkányszobrot Kína egy kiállítás erejéig kölcsönadja az Egyesült Államoknak, azzal a feltétellel, hogy a szobor biztonságos őrzését megfelelően ellátják. A feladatot a Phoenix Alapítvány és MacGyver illetve Peter Thornton kapják. Kezdetben a rutinfeladat zökkenőmentesen zajlik, ám váratlanul felbukkan MacGyver halottnak hitt egykori szerelme...

Jack Dalton és MacGyver hajmeresztő akció során megszerzik a Ming sárkányt, hogy cserébe visszaszerezzék Lisa és Kosov szabadságát. Nem is sejtik, hogy akciójuknak egy szemtanúja is akadt...

MacGyver annak idején viszontagságos úton menekítette ki Jimmyt üldözőinek karmaiból, és sikerült őt új személyazonossággal elrejtenie. Most azonban megjelent a képe egy újságban, és egykori üldözői felismerik. MacGyvernek minden leleményességére szüksége van, hogy sikeresen szembeszálljon az alvilági fickókkal és Jimmyt végleg biztonságba helyezze.

MacGyvernek a Phoenix Oktatási Alapítvány természetvédelmi akciója keretében egy határkijelölésben kell közreműködnie. A feladat ezúttal is sokkal bonyolultabb, mint előre látszott. Nem várt különleges lénnyel kell szembeszállnia egy furcsa elhagyott hajó felkutatása során.

Az utóbbi időben több nagy értékű ékszerrablás történt. Mivel a biztosítási ügynök gyanúja egy védettséget élvező diplomatára terelődik, az ügy diszkrét felgöngyölítésére MacGyvert kérik fel. Ekkor szövetkezik az ügynöknővel, Nikki Carpenterrel, hogy megfelelő bizonyítékot szerezzen a diplomata bűnösségéről.

Egy szigorúan titkos technológiát alkalmazó amerikai vadászgép lezuhan Kelet-Németországban. MacGyver és Nikki Carpenter kapják a feladatot, hogy a határon átlépve semmisítsék meg a roncsot még mielőtt a szovjet csapatok megtalálnák azt. Amikor azonban MacGycver és Nikki a helyszínre érkeznek a szovjet katonák már ott vannak. A problémákat pedig tovább fokozza, hogy Peter Strakoss, egy ismert orosz látnok, aki a hadsereget a helyszínre vezette megkörnyékezi MacGyver-t és arra kéri, segítsen neki az Egyesült Államokba menekülni...

MacGyver régi barátja, Jack Dalton segítséget kér a férfitól, mert nagy bajba keveredett Arkansasban. MacGyver azonnal a helyszínre siet, ám őt sem kerüli el a baj, amikor összeütközésbe keveredik a helyi sheriffel. Nem sokkal a szóváltás után MacGyvert ugyanabba a munkatáborba zárják, mint Daltont...

Sziklamászás közben MacGyver régi barátnője, Michele Forrester életét veszíti egy balesetben. A férfi önmagát vádolja a baleset miatt. Eközben egy profi bérgyilkos a mit sem sejtő Nikki Carpenteren keresztül MacGyver nyomára bukkan...

MacGyver örömmel vállalja el azt, hogy a diákéveinek színhelyén tartott fizikaverseny döntőbírájaként jelen legyen az eseményen. Amikor az egyik diák megnyeri a versenyt, MacGyver csalásra gyanakszik. Ezt azonban bizonyítania kéne...

Egy titokzatos merénylő veszi üldözőbe Nikkit. Amikor a lány MacGyverhez indul segítségért, a férfi nyomozni kezd. Ennek eredményeként pedig rettenetes titokra bukkan...

Ezúttal MacGyvernek egy lezuhant műholdban egy veszélyes baktériumokat tartalmazó kapszulát kell megtalálnia, amelyet egy megszállott kutató juttatott ki a világűrbe. A földet érés helyén százszámra pusztulnak az élőlények. A feladat nagyon veszélyes és igencsak nagy körültekintést igényel. Ráadásul MacGyvernek minden taktikájára szükség van, hogy a törzs elpusztítását elintézze.

Pete Thornton vonakodva bár, de nyugdíjba vonul a Phoenix Foundationtől, miután egy majdnem katasztrófába torkolló baleset következik be egy nukleáris robbanófejek szerelése közben. Emiatt, őt, mint a projekt vezetőjét vonják felelősségre. MacGyver akkor kezd gyanakodni, hogy valami még sincsen rendben az elbocsátás körül, amikor az alapítvány új vezetősége egyre több régi embert bocsát el, immár mondvacsinált indokokkal...

MacGyver barátságból elvállalja régi hokiedzőjének csapatát a bajnokságra felkészíteni. A Raidersnek esélye van megnyerni a kupát, de csak akkor, ha a legjobb játékosuk Derek Kirby a csapat rendelkezésére áll. Kirby azonban túl veszélyesen játszik és sokkal több időt tölt büntetésben, mint a jégen. MacGyver rájön, hogy neki itt elsősorban pszichiáternek kell lennie.

Jack és MacGyver a dúsgazdag örökösnőt és a 32 millió dollárt érő ékszereit szállítja a franciaországi Toulonba. A megérkezéskor derül ki, hogy kelepcébe csalták őket, Elena nem a valódi örökösnő. MacGyver és Jack kiszabadítására Pete is nagyszabású akciót tervez.

Egy gátlástalan üzletember felbéreli a profi bérgyilkos Deborah-t, hogy minden eszközzel próbálja MacGyvert meggyőzni a tervek elfogadásáról. Deborah-nak sikerül MacGyver szívét meghódítani, de a férfi sajnos csak későn eszmél rá, hogy halálos veszedelembe került.

MacGyver északon vesz részt a Phoenix környezetvédelmi programjában, amikor szörnyű pusztítás nyomaira figyel fel. A helyszínen találkozik az őslakos Earthquake-kel akinek a kutyája szörnyű kínok között pusztult el. Az okok kutatása közben MacGyvernek meggyűlik a baja egy veszélyeshulladék-megsemmisítő cég mindenre elszánt embereivel.