Gibbs és McGee két hónapja fogságban vannak, a csapat semmit sem tud róluk, de minden erejükkel azon vannak, hogy megtalálják őket. A Pentagon parancsára azonban nem foglalkozhatnának az üggyel...

A nemrég kiszabadított Gibbs-nek és McGee-nek pszichológiai vizsgálaton kell részt venniük, hogy ismételten dolgozhassanak. McGee nehezen veszi rá magát erre. Közben a csapat egy meggyilkolt katona esetén dolgozik...

Torres társa küldetés közben eltűnik, ami pedig tovább bonyolítja az ügyet, hogy egy halottnak hitt ügynökkel távozik a férfi. Gibbs és csapata mindent megtesz azért, hogy megtalálják az eltűnt nyomozót és pontot tegyenek egy rejtélyes, 10 éve megoldatlan ügy végére.

Gibbs véletlenül összetalálkozik az új törvényszéki pszichológussal, aki eleinte másnak adja ki magát, így próbára téve a férfit. A csapat egy elrabolt nő után kutat, akit később egy autó csomagtartójában találnak meg...

Clay egyik legféltettebb titka kiderül, amikor a barátját elrabolják, így kénytelen bevonni a csapatot. McGee régi és kínos képéből internetes mém válik, ami nagyon zavarja őt és mindent megtesz azért, hogy kiderítse, ki töltötte fel azt róla...

Jimmy megkéri a munkatársait, hogy adományozzanak egy speciális játszótér megépítése érdekében. Torres a nagy rohanásban véletlenül sokkal többet utal el, mint amennyit szeretett volna. Közben a csapat egy rejtélyes gyilkosság után nyomoz.

11 év után újra tárgyalnak egy gyilkossági ügyet. Az NCIS csapatát komoly vád éri, ezért Gibbs azon dolgozik, hogy mielőbb fény derüljön az igazságra...

McGee és Delilah nem tudnak megegyezni abban, hogy megtudják-e születendő gyermekük nemét vagy sem. Közben az NCIS csapatához egy médium csatlakozik...

Sloane régi jó barátját, egy MI5 ügynök férfit az orosz maffia egyik ismert tagja, André Yorka megöli. A csapat rögtön akcióba lendül, ám McGee kap egy telefonhívást, hogy Delilah szülni fog, ezért rögtön a kórházba siet. Meglepetésként éri, hogy az NCIS által keresett Yorka éppen a kórház sürgősségijén van...

Sloane és Torres Afganisztánba repülnek az amerikai szenátorral. Gibbs rossz hírrel hívja fel őket, ugyanis a szenátor fia súlyos sérülésekkel kórházba került. Sloane kerít egy tizedest, aki biztonságban elviszi őket a legközelebb induló repülőgéphez, azonban az út során megtámadják őket.

Bishop és Torres beépített ügynökként dolgoznak egy kábítószeres ügyön. Amikor már közel járnának a megoldáshoz a pár eltűnik egy hajórobbanás következtében...

A JAG egyik ügyvédje öngyilkos lesz, eleinte semmi nem utal idegenkezűségre, azonban a csapat egyre több érdekességet talál az üggyel kapcsolatban. Torres mellékesen azon dolgozik, hogy igazolványképét lecseréljék...

Torres és McGee egy cserbenhagyásos gázolás után nyomoznak, azonban az egyik gyanúsítottról megdöbbentő információkat tudnak meg. Vance lánya pedig bajba kerül, amikor bolti lopáson kapják.

Egy ellopott furgonban megtalálják a 10 napja eltűnt Willis alezredest. Gibbs és a csapat összefogva egy rég nem látott ügynökkel azon vannak, hogy mihamarabb elkapják a tettest. Abby pedig leleplezi McGee titkát...

Sloane szemtanúja lesz, amint barátnője, Jessica autója felrobban. Az első számú gyanúsított az ügyben Hicks, akit tévesen engedtek ki a börtönből. Gibbs és a csapat bizonyítékokat keresnek, arra, hogy a férfi valóban bűnös. Az NCIS nem várt segítséget kap, aminek McGee nem örül...

Egy volt tengerészgyalogost súlyos vádakkal illetnek, ezért Gibbs minden erejét bevetve azon dolgozik, hogy tisztázza a férfit. Az ügy érdekes fordulatot vesz, amire senki sem számított...

Doki és Gibbs egy 16 évvel ezelőtti bűntény kulcsfontosságú bizonyítékát találják meg, amivel végleg pontot tehetnek a megoldatlan ügy végére. Abby minden erejével azon van, hogy Doki asszisztense megkedvelje őt.

Káosz tör ki az NCIS épületénél, amikor egy detonátor felrobban. Először véletlennek hiszik az esetet, majd kiderül, egy tégla van a csapatban, aki bentről segítette a bűnözőket, hogy sikerrel járjanak.

Két halott ügyében nyomoz a csapat, akik valószínűleg utcai harc során veszthették életüket. Az eset bonyolódik, amikor egy 10 éves kislány válik egy ismert drogkartell célpontjává. Gibbs rögtön a kislány védelmére kel és magához veszi.

Egy rendőr egy ittas vezető üldözése közben a tóban landol autójával. Az ügy tanúja egy vak nő, aki többet tud segíteni, mint amit a csapat gondolna, bár Torres eleinte kétkedve fogadja a fültanút. Doki az internet segítségével kíséri figyelemmel a labor működését.

Hatalmas felháborodást vált ki országszerte az eset, amikor az NCIS épülete előtt letartóztatnak egy nőt, aki csak az édesanyja halálának okát szeretné megtudni. Gibbs eleinte nem hajlik a segítségre, ám kiderül, hogy az elhunyt veterán volt.

Abbyt és Reevest megtámadják az utcán, ami látszólag fegyveres rablás, ám kiderül, hogy egy jól kitervelt merényletet követtek el ellenük. Abby súlyos állapotban kórházban fekszik. Gibbs mindent elkövet, hogy elkapja a tettest vagy tetteseket.

Gibbs régi barátja, Phil váratlanul eltűnik. A partiőrség feladja a kutatást és halottnak nyilvánítják. Egy véletlen folytán azonban kiderül, hogy a férfi mégis él és menekül, ugyanis valaki meg akarja ölni. Bishop nehezen tudja feldolgozni Reeves halálát, így Sloane segít neki.

Sloane vakrandira készül, amit Delilah szervezett neki. A találkozás jól sikerül, ám egy régi ismerős a múltból előhozza Sloaneból a rossz emlékeket. Eleinte Leon és McGee dolgozik az ügyön, majd Gibbs vezetésével az egész csapat segít Sloanenak.