Az egyik replikátor túlélte Thor hajójának becsapódását és eljutott a Földre. Ha nem sikerül megállítani mielőtt szaporodni kezdene, a Földnek még a Goa'uldoknál is nagyobb fenyegetéssel kell szembenéznie.

A Csillagkapu Parancsnokság segélykérő jelzést fog egy másik bolygóról. A bolygólakókat ellenségeik miatt a pusztulás fenyegeti és a segítségünket kérik. A CSK-1 elutazik a bolygóra, hogy segítsen, de ahogy a helyzet egyre súlyosabbá válik felfedezik, hogy nem minden az, aminek látszik.

Egy Tok'ra archeológus a Csillagkapu Parancsnokságra látogat, hogy megvizsgáljon egy eszközt (armband device), aminek segítségével a CSK-1 emberfölötti dolgokra képes.

A Csillagkapu Parancsnokság vendégül lát egy nőt Teal'c múltjából. A Jaffa azt állítja, hogy képes kommunikálni a szimbiontájával és sikerült meggyőznie, hogy a Goa'uldok ellen forduljon. Ha ez igaz, akkor a szimbionta rengeteg információt nyújthat. De a kérdés továbbra is az, hogy vajon ez-e az áttörés, amire vártunk vagy csak egy alaposan kidolgozott csapdába sétálunk.

Amikor a Csillagkapu Parancsnokság egyik tagja megőrül és megpróbál megölni egy Tok'ra tisztviselőt kiderül, hogy a katona olyan Goa'uld agykontroll eljárásnak volt az áldozata, ami erőszakos, öngyilkos tettekre programozza be az embereket. A Tok'rák a Csillagkapu Parancsnokság teljes személyzetét átvizsgálják és műszereikkel azt találják, hogy Carter és O'Neill is áldozatul estek az agymosásnak.

O'Neill és Teal'c bentragadnak egy időhurokban és folyamatosan újraélnek néhány órát a Csillagkapu Parancsnokságon.

Az oroszok felszínre hozták az óceán mélyén fekvő csillagkaput és titokban küldetéseket vezetnek. Egyik küldetés után viszont nem csukódik be a kapu. Kénytelenek felfedni titkukat és a CSK-1 segítségét kérni.

A CSK-1 ellátogat a Goa'uld szimbionták anyabolygójára.

A CSK-1 sikeresen áttelepített egy civilizációt egy új bolygóra, de a bolygót egy másik civilizáció éppen megsemmisíti.

A CSK-1 csapatának kitörlődnek az emlékei és kényszermunkásként kell dolgozniuk egy jeges bolygó felszíne alatt, hogy a felszín felettiek jól tudjanak élni.

A CSK-1 kapcsolatba kerül egy összeesküvés-elméletekkel foglalkozó alakkal, aki hallott a csillagkapuról. Ráadásul azt hiszi magáról, hogy földönkívüli és halvány emlékei vannak egy idegen életformáról.

A légierő átépít egy zsákmányul ejtett halálsiklót. O'Neill ezredes és Teal'c kipróbálják a járművet, de az űrben elvesztik az irányítást.

Amikor korábbi oktatója és munkatársa meghal, Daniel Jackson visszatér gyökereihez - és felfedez egy ősi egyiptomi leletet, melyben egy Goa'uld szimbionta van.

Amikor Apófisz és Hórusz szövetségre lép, a CSK-1-nek meg kell állítania őket. Teal'c Chulakra megy, hogy segítséget kérjen a Jaffa harcosoktól, de fogságba esik.

A CSK-1-nek hozzá kell szoknia egy új parancsnokhoz, miután Hammond tábornok visszavonul.

2010-ben a CSK-1 tagjai úgy döntenek, hogy megváltoztatják a saját múltjukat, hogy megmenthessék a Földet.

A CSK-1 Abydoson találkozik Shifuval, Apófisz és Sha're közös Harsesis gyermekével, aki új lehetőségeket kínál Dr. Jacksonnak.

A CSK-1 csapata technikai problémákba ütközik, miközben egy Goa'uld palotát látogatnak meg.

Carter egy rendkívül ügyes, de engedetlen tanuló útját egyengeti a csillagkapu segítségével. Az egyszerű gyakorló út halálos fordulatot vesz, amikor megtámadják őket...

Egy földön kívüli vírus behatol a Csillagkapu Parancsnokság számítógépes rendszerébe, és belepiszkál a titkos adatokba.

A CSK-1-t fogságba ejti a Goa'uld Kronosz és kivégezteti Daniel Jacksont.

A CSK-1 meglátogatja Vorash nevű bolygót, a Tok'ra lázongás bázisát. Carter és Jack O'Neill elcseveg a Tok'ra és Tau'ri stratégiáiról. (1. rész)