Jenna Flemming arra biztatja Vance igazgatót, hogy vállaljon pozíciót a kongresszusban. McGee lakásában betörők járnak, és egyiküket lelövi. A nyomozás során a szálak egy tizenöt éve megoldatlan gyémántlopási ügyhöz vezetnek.

Gibbst arra kéri régi barátjának rákos beteg lánya, Laura, hogy segítsen felderíteni egyik tengerésztársának halálát. A nyomozás során kiderül, hogy kábítószerbiznisz van az ügy hátterében, és Gibbs Torrest a kórházba küldi, hogy vigyázzon Laurára. Torres nem hajlandó vállalni a feladatot.

A csapatnak egy bosszantó vietnami háborús veteránra kell támaszkodnia, hogy megtalálja Andrew Back tizedes gyilkosát.

McGee és a csapat versenyez, hogy ki találja meg a hackert, aki felelős az altábornagy laptopjának megfertőzéséért.

Egy tengerészgyalogos meggyilkolása összeköthető egy régi cross motoros bandával, amelynek Torres is tagja volt fedettügynökként.

A csapat együttműködik a lovasrendőrséggel, hogy elkapjon egy gyilkost, aki megölt egy tengerésztisztet a nemzeti parkban. Fel kell számolniuk egy illegális afrikai húscsemépsz hálózatot is.

McGee és Delilah küszöbön álló esküvőjének stressze Delilaht kórházba juttatja. Az NCIS csapatát egy haditengerészeti rombolóra hívják, hogy megvizsgálják egy egészséges, fiatal tiszt halálát. A holtest azonban titokzatos módon eltűnik.

Gibbs, McGee és Torres Paraguay közelébe utazik, egy helyre amelyet egy lázadó erőszakos csoport irányít. Megpróbálnak megtalálni egy haditengerészt, aki eltűnt egy nem jóváhagyott út során.

Gibbs és McGee két hónapja fogságban vannak, a csapat semmit sem tud róluk, de minden erejükkel azon vannak, hogy megtalálják őket. A Pentagon parancsára azonban nem foglalkozhatnának az üggyel...

A nemrég kiszabadított Gibbs-nek és McGee-nek pszichológiai vizsgálaton kell részt venniük, hogy ismételten dolgozhassanak. McGee nehezen veszi rá magát erre. Közben a csapat egy meggyilkolt katona esetén dolgozik...

Torres társa küldetés közben eltűnik, ami pedig tovább bonyolítja az ügyet, hogy egy halottnak hitt ügynökkel távozik a férfi. Gibbs és csapata mindent megtesz azért, hogy megtalálják az eltűnt nyomozót és pontot tegyenek egy rejtélyes, 10 éve megoldatlan ügy végére.

Gibbs véletlenül összetalálkozik az új törvényszéki pszichológussal, aki eleinte másnak adja ki magát, így próbára téve a férfit. A csapat egy elrabolt nő után kutat, akit később egy autó csomagtartójában találnak meg...

Clay egyik legféltettebb titka kiderül, amikor a barátját elrabolják, így kénytelen bevonni a csapatot. McGee régi és kínos képéből internetes mém válik, ami nagyon zavarja őt és mindent megtesz azért, hogy kiderítse, ki töltötte fel azt róla...

Jimmy megkéri a munkatársait, hogy adományozzanak egy speciális játszótér megépítése érdekében. Torres a nagy rohanásban véletlenül sokkal többet utal el, mint amennyit szeretett volna. Közben a csapat egy rejtélyes gyilkosság után nyomoz.

11 év után újra tárgyalnak egy gyilkossági ügyet. Az NCIS csapatát komoly vád éri, ezért Gibbs azon dolgozik, hogy mielőbb fény derüljön az igazságra...

McGee és Delilah nem tudnak megegyezni abban, hogy megtudják-e születendő gyermekük nemét vagy sem. Közben az NCIS csapatához egy médium csatlakozik...

Sloane régi jó barátját, egy MI5 ügynök férfit az orosz maffia egyik ismert tagja, André Yorka megöli. A csapat rögtön akcióba lendül, ám McGee kap egy telefonhívást, hogy Delilah szülni fog, ezért rögtön a kórházba siet. Meglepetésként éri, hogy az NCIS által keresett Yorka éppen a kórház sürgősségijén van...

Sloane és Torres Afganisztánba repülnek az amerikai szenátorral. Gibbs rossz hírrel hívja fel őket, ugyanis a szenátor fia súlyos sérülésekkel kórházba került. Sloane kerít egy tizedest, aki biztonságban elviszi őket a legközelebb induló repülőgéphez, azonban az út során megtámadják őket.

Bishop és Torres beépített ügynökként dolgoznak egy kábítószeres ügyön. Amikor már közel járnának a megoldáshoz a pár eltűnik egy hajórobbanás következtében...

A JAG egyik ügyvédje öngyilkos lesz, eleinte semmi nem utal idegenkezűségre, azonban a csapat egyre több érdekességet talál az üggyel kapcsolatban. Torres mellékesen azon dolgozik, hogy igazolványképét lecseréljék...