Ziva halálhírére Tony összeomlik, de a Moszad igazgatója nagy meglepetést szerez neki. Clayton Reeves úgy gondolja, hogy talán Jacob Scott olyasmit tudhat Trent Kort-ról, amivel segítheti a nyomozást, és igaza is lesz.

Gibbs csapata mindent elkövet azért, hogy a feltételezett merénylőt megelőzze, de késve érkeznek a helyszínekre. Amikor Jacob Scott feladja magát, rájönnek, hogy ki áll a gyilkosságok mögött.

A nyomozás miatt Fornell ügynök és Vance igazgató Angliába utaznak, mert Gibbs-nek egy másik ügyben kell intézkednie. Csapatának egy tengerészgyalogos fiát kell megvédenie, aki gyilkosság szemtanúja volt.

Egy londoni börtönből megszökik két rab, és az Egyesült Államokba menekül. Egyikük brit titkosügynök volt, akit árulásért kaptak el az NCIS segítségével. A műveletet az akkori NCIS-igazgató, Tom Morrow vezette.

Vance igazgató kíséretében DiNozzo találkozik Bransfield szenátorral, aki szemétládának nevezi, és 20.000 dollárt ad neki egy borítékban. Kiderül, hogy valaki ellopta Tony igazolványát, és a nevében zsarolta a szenátort. DiNozzo még jobban meglepődik, amikor a nyomozás során kiderül, hogy további két szenátort is megzsaroltak, tehát három ál-Tony létezik.

Egy lelőtt férfi és két lehetséges elkövető: a feleség és a szerető, akik egymást vádolják gyilkossággal. A nyomozás kideríti, hogy mindkettejüknek volt indítéka. Közben Tony apja unatkozik, és arra vágyik, hogy valami hasznosat tegyen.

Irakban, egy amerikai katonákat ért támadás után terroristák kezére kerül egy messzehordó távcsöves fegyver prototípusa. A támadás egyetlen túlélője poszttraumás stressz szindrómával küszködik, pedig nagy szükség lenne a segítségére, hogy megállítsák az orvlövészt, aki használni akarja a fegyvert. Gibbs elhatározza, hogy szóra bírja a katonát.

Egy átlagos nap délutánján nagyon egyszerű ügyhöz riasztják Gibbs csapatát. Hamar végeznek is, majd mindenki örömmel indul haza. Aztán éjjel a tetthelyen mindnyájan megjelennek, mert kiderül, hogy egyiküket sem hagyta nyugodni pár furcsaság.

Egy tengerészgyalogosokat ért támadás kapcsán Dr. Cyril Taft ráérez az ügynöklét izgalmaira, és nagyon élvezi. DiNozzo annál kevésbé, mert a nyomok La Grenouille-hoz vezetnek vissza, és ismét találkoznia kell Jeanne-nal.

A tengerészetért felelős miniszterasszony, Sarah Porter lányát elrabolják a barátjával együtt. A fiút később szabadon engedik, majd használható információkkal szolgál. Aztán kiderül, hogy az emberrablóknak nem elég a váltságdíj.

Egy búvárhajón egy haditengerész halála balesetnek tűnik. Ám idővel túl sok a kérdőjel és a kétértelműség, a búvár kollégái pedig egymást vádolják. És mindezt Valentin-napon.

Egy halott lányban Palmer egy mikrochip maradványait találja, amiről Bishop-nak eszébe jut egy régi esete. Még az NBH-nál dolgozott, amikor felgöngyölítettek egy lánykereskedő-hálózatot, amelyik hasonló chipeket használt a nők követésére. Megkeresi hát régi kollégáit, hogy segítsenek nekik.

Egy magánrepülőgép lezuhanása után kiderül, hogy mindenki meghalt, és a halál oka mérgezés volt. Az utaslista szerint az ötödik utas Abby testvére kellett volna legyen, de helyette egy idegen férfit találnak a fedélzeten. Az ügyön Gibbs csapata együtt dolgozik a New Orleans-i ügynökökkel.

Dr. Mallard egy telefonhívást követően sietve távozik a boncteremből. Órák múlva egy sikátorban találják meg egy furgonban, megkötözve. Elmondja, hogy egy férfival találkozott, aki kérdezősködött Nicholas-ról, Doki régen elhunyt féltestvéréről. Azonban a gyanúsított holmijában talált levélről Abby megállapítja, hogy Nicholas írta három héttel korábban.

Paulette Quinn már elvesztette két gyermekét Irakban, középső fia leukémiás, a legkisebb pedig eltűnt. Megfelelő csontvelő-donor lenne számára Richard Doogan, aki viszont kettős emberölésért életfogytig tartó börtönbüntetését tölti. Bishop, akit zavar az anyja és a bátyja pátyolgatása, örül, hogy segíthet.

Egy fiatal tengerésztiszt ellen ejtik a gyilkosság vádját egy formai hiba miatt, de a fiatalember segítséget kér Gibbs-től. Új eljárást szeretne, hogy bebizonyítsa az ártatlanságát. A nyomozás során a csapat olyan bizonyítékokat talál, amelyek másra terelik a gyanút. Ellie ugyan nagyon örül, hogy Jack épségben hazatért, de a férfi viselkedése aggályokat ébreszt benne, és mint utóbb kiderül, nem alaptalanul.

Egy dél-szudáni merénylet kapcsán DiNozzo és Jeanne Benoit újra találkoznak. Gibbs azonnal oda akar utazni, de ekkor összeesik az irodában. Teft doktor szeretné, ha csoportterápiára járna, ám erre persze nem hajlandó.

Egy nyugalmazott tiszt meggyilkolása kapcsán kiderül, hogy Doki tagja egy régi bűnügyeket megoldani próbáló amatőr nyomozó társaságnak, a Sherlock Nyomozó Konzorciumnak. Hayes őrnagy fiát 16 évvel korábban elítélték gyilkosságért, amit szerinte nem is a fia követett el. A nyomozás során kiderül, hogy Abby is érintett az ügyben.

Egy haditengerész halálakor a nyomok a "céltáblás" sorozatgyilkosra utalnak, de Gibbs csapata hamar rájön, hogy egy másoló lehet a tettes. McGee és Delilah arra készülnek, hogy összeköltözzenek, de ez nem megy súrlódások nélkül. Ellie eközben nagyon aggódik Jack miatt.

Abby szeretne az alagsorból kiköltözni, ezért Gibbs-től kér segítséget. De közben egy tengerésztiszt halála miatt elmegy egy gyógyszercéghez, amelyet Ebola-riasztás miatt karanténba helyeznek.